또한 총장 및 이사장에게 집중돼 있는 권한을 분산한 뒤 교수회 통폐합, 대학평의회 정상화, 이사회·대학간 권한의 합리적인 재조정, 전결 규정 재구성 등 '재단 및 대학 운영 시스템 재구축'도 제안했다. 특히 동문회는 김 총장이 이사장직을 수행할 때 지금까지 야기된 도덕적·법률적인 문제 때문에 대외적인 이미지가 실추되거나 대내적인 리더십에 문제가 있을 수 있다고 보고 이런 문제점을 더 이상 거론하지 않겠다는 약속도 했다. 하지만 김윤배 총장은 응답하지 않았다.

한편 청주대는 지난 23일, 24일 학생 5318명에게 1인당 100만원의 장학금을 등록금 범위내에서 지급했다. 기존 장학금 외에 이번에 48억원을 ‘학업장려 장학’이라는 명목으로 지급해 무마책이 아니냐는 지적이 일고 있다.

평균학점 2.6 이상이고 학년별 일정한 학점을 취득한 학생들을 대상으로 한 이 장학금은 장학심사와 학업장려장학 계좌 수집을 거쳐서 줬다. 이번에 장학금을 갑자기 받게 된 학생들의 반응도 제각각이다. 장학금 지급자 중 3명의 학생은 장학금을 아예 돌려주기도 했다. 그 가운데 한 학부모는 “이러한 성격의 장학금은 받을 수 없다”며 거부했다. 장학금의 출처 또한 분명치 않다. 총학생회 관계자는 “기획예산팀에게 어느 항목에서 예산이 지출되는지 문의했지만 답변을 못 받았다”라고 비판했다.

청주대 측은 “등록금 회계에서 현재 등록금을 지급한 상태다. 적립금 회계에서 지출하려면 재단 이사회를 거쳐야 하는 데 그 사이 이사회가 열리지 않았다”라고 설명했다. 따라서 적립금을 푼 것이 아니라 등록금 회계에서 지출한 것이다.

청주대는 이번에 국가장학금 2유형 교부금(정부교부금 42억), 학업장려장학금(교비 48억), 사랑나눔장학금(저소득층대상 지급․교비 20억)을 지급했다. 그 가운데 학업장려장학금은 2014년 2학기에만 한시적으로 생긴 것이다.